Generation and genotyping of single cell ESC clone

ESC单克隆的生长
将细胞用accutase进行消化,然后使用P1000枪头温和吹打使细胞分离成单细胞。
对单细胞悬液进行计数,并稀释到1e4/ml密度。
将细胞种到6孔板中,每个孔种100ul (1000个细胞)。
细胞培养7-10天,待单细胞长成克隆。

ESC单克隆的挑选
准备48孔板及培养液。
将倒置显微镜用70%酒精擦拭,并置于超净台中(也可用紫外灯照射消毒显微镜及其他所需物品)。
准备1.5ml EP管,每管加入100ul培养液。
将六孔板置于显微镜下,调整显微镜并找到目的克隆。
使用单克隆挑选装置,用10ul枪头将目标克隆刮下来,然后吸到枪头中。
将枪头中吸取的克隆完全吹到1.5ml EP管中,盖上EP管得盖子。
进行下一个克隆的操作,直到挑选足够的克隆。
将细胞克隆从1.5ml EP管中转移到48孔板中,放到培养箱中进行培养(可将48孔板在200g离心2分钟帮助细胞贴壁)。
大概经过一周左右,根据细胞的生长情况进行传代操作。

ESC细胞的传代:
准备24孔板,每个孔种加入500ul培养液。
吸掉48孔板中旧的培养液,每个孔加入100ul versene,37℃孵育8-10分钟。
用手拍打48孔板,使ESC从培养表面脱落下来。
使用P200枪头,每个孔吸取25ul细胞悬液,转移到24孔板中。(操作的过程中注意对每个孔做好标记,以免混淆)
将24孔板放回培养箱进行培养。
将48孔板中每个孔中剩余的大概75ul细胞悬液转移到PCR管八联管中,做好标记。
将八联管离心收集细胞沉淀。
使用8通道排枪,调到手动模式,设置65ul量程,小心吸取八联管每管中的上清,不要吸到细胞沉淀。
将细胞冻存在-20或-80冰箱中。

ESC细胞的鉴定:
取出冻存的八联管,融化后轻弹管底使细胞分散。
向八联管中每管加入30ul Quick-extract裂解液,涡旋混匀然后再离心。
放入PCR仪,65℃ 10min, 68℃ 10min, 95℃ 10min, 10℃ hold。
每个PCR反应加入1ul裂解液作为模板。